| Il protagonista di questo manga è Setsuna Mudo, a cui viene rivelato di essere la reincarnazione di un bellissimo angelo femminile Alexiel, che per essersi ribellato a Dio fu costretto alla perpetua Metempsicosi.
Ogni sua reincarnazione segue la linea di un tragico destino: Un amore impossibile e una morte repentina. Sono due demoni, che volevano riportare in vita Alexiel, a svelare a Setsuna il suo destino. In contemporanea, il serafino Catan, trova il modo per tirare fuori dal limbo, Rosiel, angelo inorganico e fratello gemello di Alexiel, nonché suo esatto opposto.
Appena liberato Rosiel ordina a Catan di risvegliare Alexiel. Catan scopre Setsuna e cerca anche lui di risvegliarlo, ma per lui diventa molto difficile perché Setsuna è accompagnato dalla sorella Sara di cui è innamorato e dal sempai Kira. Rosiel arriva a dover controllare le persone per poter risvegliare Alexiel ma l'unica cosa che ottiene è far fuggire Setsuna con la sorella in un paese straniero; i due, innamorati, decidono di vivere lontano dal Giappone, ma scoprono che Kira viene arrestato per qualcosa che in realtà ha fatto Setsuna.
Tornano in Giappone e allora Rosiel ingaggia Kirye per eliminarlo, ma per errore uccide invece Sara. Setsuna vedendo lei morire si arrabbia e risveglia la forza dell'angelo che c'è in lui distrugendo il mondo intorno a loro. Mentre si scatena la furia di Setsuna nella mente gli parla Adam Kadamon. Un angelo dalle 6 ali che possiede tutti i poteri ed è il "padre" di Alexiel e Rosiel , che lo fa fermare. Stringe un patto con Setsuna. Gli rivela il modo per andare all'inferno a prendere l'anima peccatrice di Sara (peccatrice perché innamorata del fratello) e ferma il tempo sulla terra in modo che non avvenga nessun danno irreparabile al pianeta.
Setsuna accetta e in cambio promette ad Adam di andare in Paradiso per liberarlo e per aiutare gli angeli. Setsuna scende all'inferno in cerca dell'anima della sorella ma scopre che non è lì ma è stata portata in paradiso da un serafino chiamato Zafkiel. Qui però trova Uriel l'angelo della Terra, autore della condanna di Alexiel. Setsuna torna indietro, ma nel frattempo il suo corpo in morte apparente è stato definitivamente ucciso per errore da un demone, e allora, nel tornare indietro, entra in quello che era il corpo di Alexiel.
Qui si scopre che in realtà Kira non è davvero chi dice di essere ma, dopo una serie di peripezie, si scopre che in realtà Kira è la reincarnazione della spada di Alexiel (Nanatsusaya), la spada a sette punte, che è l'anima di Lucifero. Setsuna decide di andare in paradiso allora per riprendersi l'anima della sorella Sara.
Qui scopre che gli angeli versano in difficoltà. Comandati da Sevoftarta, un angelo perfido che vuole a tutti i costi mantenere il potere, alcuni angeli si ribellano e creano una resistenza. Il capo della resistenza è proprio Zafkiel. Arrivato in paradiso scopre che l'anima di Sara è in realtà l'angelo Djibril dell'acqua che si rivolge a Raphael per arrivare da Setsuna e riportarlo in vita. A Setsuna viene chiesto di diventare il comandante della ribellione e nel frattempo trova Sara. Zafkiel si arrende per permettere a Setsuna di scappare. Rosiel spodesta Sevoftarta e il nuovo angelo supremo Metatron. La mente di Lucifero prende possesso di Kira che passa dalla parte di Rosiel. Dopo una guerra arrivano di fronte a Dio, di cui viene svelata la vera identità tutt'altro che benevola, e scoprono che gli angeli, tutti gli angeli, sono in realtà nati da parti del corpo di Adam, e che Metatron aveva un gemello Sandalphon, che era cattivo e aveva preso possesso di alcuni angeli per spodestare il potere che c'era e prenderlo lui stesso.
Durante il viaggio di Setsuna veniamo a sapere le storie passate di molti personaggi.
Alla fine l'autrice del manga ci fa capire che né angeli né demoni e nemmeno gli umani sono diversi tra loro e che ognuno ha le sue debolezze. L'assunto è che ogni razza più tende alla perfezione e più cose deve nascondere e vietare.
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